Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln3Q61124 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln3Q61124 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Cln3Q61124 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Cln3Q61124 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cln3Q61124 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms