Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxd3Q61060 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd3Q61060 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms