Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Klf3Q60980 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms