Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms