Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RelnQ60841 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RelnQ60841 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RelnQ60841 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RelnQ60841 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RelnQ60841 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RelnQ60841 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RelnQ60841 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RelnQ60841 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RelnQ60841 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RelnQ60841 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RelnQ60841 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RelnQ60841 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RelnQ60841 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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