Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn2cQ60772 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn2cQ60772 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms