Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a1Q60737 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms