Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SkiQ60698 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SkiQ60698 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SkiQ60698 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms