Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd4Q60688 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms