Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sema5bQ60519 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema5bQ60519 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms