Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gprasp1Q5U4C1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gprasp1Q5U4C1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gprasp1Q5U4C1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gprasp1Q5U4C1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gprasp1Q5U4C1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gprasp1Q5U4C1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gprasp1Q5U4C1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gprasp1Q5U4C1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms