Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brip1Q5SXJ3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms