Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsr1Q5SWD9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms