Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd40Q5SUE8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms