Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fam71bQ5STT6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam71bQ5STT6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms