Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psme4Q5SSW2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psme4Q5SSW2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms