Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim58Q5NCC9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms