Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm12253Q5NC48 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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