Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1810065E05RikQ5NC41 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1810065E05RikQ5NC41 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms