Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf2Q5NC05 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms