Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vps41Q5KU39 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms