Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkaa1Q5EG47 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms