Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Afap1l2Q5DTU0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms