Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urb1Q571H0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms