Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf608Q56A10 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf608Q56A10 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Znf608Q56A10 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Znf608Q56A10 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf608Q56A10 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf608Q56A10 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf608Q56A10 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf608Q56A10 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf608Q56A10 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms