Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prune2Q52KR3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms