Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms