Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms