Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnl1Q52KE7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnl1Q52KE7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms