Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC17

Adamts18, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts18Q4VC17 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms