Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc3lQ4KL14 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms