Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lin28bQ45KJ6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lin28bQ45KJ6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lin28bQ45KJ6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lin28bQ45KJ6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lin28bQ45KJ6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lin28bQ45KJ6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lin28bQ45KJ6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lin28bQ45KJ6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms