Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim26Q3V460 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim26Q3V460 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms