Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pydc3Q3V3Q4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pydc3Q3V3Q4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms