Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3K7

Gcnt7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt7Q3V3K7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcnt7Q3V3K7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcnt7Q3V3K7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcnt7Q3V3K7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcnt7Q3V3K7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcnt7Q3V3K7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcnt7Q3V3K7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcnt7Q3V3K7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcnt7Q3V3K7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcnt7Q3V3K7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcnt7Q3V3K7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcnt7Q3V3K7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gcnt7Q3V3K7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt7Q3V3K7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms