Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmub2Q3V209 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmub2Q3V209 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms