Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms