Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Garnl3Q3V0G7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms