Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed1Q3V009 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms