Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc160Q3UYG1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms