Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E330034G19RikQ3UWX6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms