Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim40Q3UWA4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms