Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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