Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BB287469Q3UT53 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms