Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf48Q3US17 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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