Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skap2Q3UND0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skap2Q3UND0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms