Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl2Q3UMU9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl2Q3UMU9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms