Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrch2Q3UMG5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms