Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cog7Q3UM29 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms