Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E330014E10RikQ3UL33 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms